2009年1月12日，国家林业局以林湿发[2008]265号文件下发了《全国湿地资源调查技术规程（试行）》。该《技术规程》是指导全国第二次湿地资源调查的纲领性技术文件。
早在2003年，在首次全国湿地资源调查刚刚结束之后，针对起调面积大、调查指标规定不严格、各地具体调查方法不一致等问题，国家林业局就着手第二次调查的准备工作，并在海南省组织开展了湿地资源调查的试点工作，形成了《技术规程（初稿）》。2007年7月24-25日，国家林业局湿地保护管理中心在哈尔滨召开了由10个省（自治区）林业厅（局）保护处长、相关技术负责人和8位专家参加的《技术规程》研讨会。根据研讨会的意见和建议，国家林业局湿地监测中心对规程的编写体例、湿地分类系统、遥感技术的应用、土壤分类、地貌分类、湿地边界的界定、湿地调查区划等内容进行了细致的修改完善。
为了检验《技术规程》的可行性和可操作性，国家林业局湿地保护管理中心选择了广西的钦州湾、湖南的南洞庭湖、四川的若尔盖、河北的坝上湿地开展了调查试点工作。2007年10月27-28日，在北京召开了由试点省份主要技术人员参加的规程培训班。同时又召开了由水利、海洋等部门管理人员和专家参加的咨询会，就《技术规程》的湿地分类、湿地边界界定等内容进行了咨询。
2007年12月，国家林业局湿地保护管理中心将《技术规程（征求意见稿）》下发各省、自治区、直辖市林业厅（局），森工（林业）集团公司，国家林业局驻各地专员办以及相关专家，进行征求意见。编写人员对回收的122条意见逐一进行整理分析，进一步完善了《技术规程》。2008年7月10日，湿地保护管理中心又在长春组织了10位专家对《技术规程》进行了研讨，专家对湿地分类系统、湿地斑块的边界界定、调查因子、调查区划、遥感应用等方面提出了宝贵的意见和建议。
2008年11月28日，国家林业局科技委在北京组织召开了《全国湿地资源调查技术规程》专家论证会。会议由国家林业局科技委副主任江泽慧教授主持。来自中国科学院、中国工程院、中国林科院等单位的21位专家参加了会议。与会专家认为，《技术规程》编写指导思想明确，编写原则科学，编写依据充分，规程内容全面，是一个比较完善的技术文件，一致同意通过《技术规程》的论证。