1、水源保护
当前，我国许多饮用水水源具有富营养化的趋势，严重威胁居民饮用水安全。富营养化 水源水与一般意义上的微污染水源水相比，不仅氨氮和耗氧量超标，而且由于含藻量高更增加了给水处理的难度。人工湿地应用于污水处理已近半个世纪，有着能耗低、简单易行、良好的净化效果和独特的生态功能。采用水生植物床构成的人工湿地生态净化系统处理富营养化水源水，处理过程中不会产生新的“三致”物和“优先污染物”，避免了二次污染。
2、景观用水
如何处理景区的生活污水和养殖废水一直以来是个难题，在风景区建造污水处理厂是不可能的。用地下水或自来水则成本太高，使景区难以维持。人工湿地在处理污水的同时，又美化了周围环境，因此，在风景区通过建立人工湿地处理污水是解决景观用水的最好途径。
3、工业废水
人工湿地是进行工业污水处理的一种有效手段，人工湿地能有效去除酚、甲醇、乙醇、单甲基苯胺、cod等污染物，去除率达95%以上。对某些水需求量比较大的企业还能实现污水净化回用，大量节约成本，并实现污水零排放。
4、生活污水
城市生活污水由于分散排放导致处理难度加大，利用人工湿地能很好地解决这个问题。建设城市湿地公园，既能进行城市生活污水的净化处理，又能增加城市绿地面积，能创造良好的环境效益和社会效应。人工湿地不受规模限制，既能对污水进行集中处理也能进行污水的分散处理，是城市污水处理的最有效的手段。
5、农村面源
随着农业的发展，大范围大规模的使用化肥使得农田径流中含有大量营养物，农村养殖业的发展也产生了大量农业废水，这些废水是导致湖泊等水体富营养化的重要原因。利用人工湿地处理农田径流和农业废水，能大大降低水体中营养物的含量，对湖泊等水体的面源污染治理有着重要意义。
6、暴雨径流
自20世纪80年代以来，城市道路和高速公路等雨水系统在雨季排放的雨水径流含有许多污染物，如有机物、油、洗涤剂和重金属等，直接排入水体会污染水环境和破坏水资源。采用人工湿地的方法能有效地处理雨水。
7、垃圾渗漏
垃圾渗滤液中含有大量有毒的有机化合物和重金属，对地表水和深层地下水产生巨大威胁，处理不好极容易对地表水和地下含水层产生污染。利用人工湿地的方法处理垃圾渗滤液能很好地解决这个问题，人工湿地是一个完全自然的系统，并且能够充分利用地形进行重力排水，不需要添加化学药剂避免二次污
8、污泥脱水
如何减少城市污水处理中产生的污泥处理、脱水和处置费用，是一个亟待解决的问题。在使用原有污泥脱水工艺和设备情况下，要求购置、安装和运行费用低廉，还要达到标准是不现实的。但用人工湿地就可以实现上述处理要求。湿地植物在消化污泥中能茁壮生长，并且有利于污泥的脱水和稳定化，它们的根系可以贯穿实地上部的污泥储存层，把氧气带到根部，可以使周围许多微生物得以生长，这些细菌以污泥中的有机物为养料。